Microbiota y probióticos en veterinaria
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Microbiota y probióticos en veterinaria - Juan Miguel Rodríguez Gómez
CAPÍTULO 1
PRESENTACIÓN: LA MICROBIOTA Y LOS PROBIÓTICOS EN EL ÁMBITO VETERINARIO
Juan Miguel Rodríguez Gómez
1.1 El intestino, un órgano peculiar
El intestino podría definirse como el «patito feo» de nuestro organismo. A simple vista, parece un órgano triste, gris e incluso decepcionante, resignado a jugar un papel secundario y eminentemente «escatológico». Sin embargo, se trata de una de las partes del cuerpo de los animales, incluyendo por supuesto la especie humana, que más sorpresas está deparando a la comunidad científica en los últimos años, de tal manera que actualmente aparece ante nosotros como un órgano realmente fascinante.
En primer lugar, se trata de un órgano inmenso, por el que pasan continuamente grandes volúmenes de alimentos, sustancias químicas y microorganismos, algunos potencialmente patógenos. Por otra parte, se encarga de llevar a cabo una operación de salvamento notablemente eficaz: el rescate de los nutrientes esenciales existentes en un magma intermitente de alimentos y agua. Para conseguirlo, tiene que conducir este contenido a una velocidad adecuada, aportar diversas secreciones, realizar labores de digestión, absorber los productos digeridos, los electrolitos y el agua, enviar este material hacia el torrente circulatorio y, finalmente, expulsar los productos de desecho.
Por si esto fuera poco, es el anfitrión de una microbiota ciertamente compleja y el principal órgano del sistema inmunitario, realizando una concienzuda labor de muestreo del ambiente entérico y teniendo que mantener un difícil equilibrio: controlar con firmeza los patógenos, tolerar a los comensales y originar respuestas proporcionadas frente a multitud de antígenos con los que tiene contacto. Pero aún hay más; el intestino mantiene un constante intercambio de información con el cerebro y con otros órganos a través de una compleja red de señales nerviosas, metabólicas y endocrinas. El sistema nervioso entérico es un vasto almacén químico en el que están representadas todas y cada una de las clases de neurotransmisores que operan en nuestro cerebro. Su cometido va mucho más allá de la supervisión de los ya de por sí complejos procesos digestivos e incluye la producción de sustancias psicoactivas. El cerebro entérico recibe en todo momento información desde el cerebro, pero nadie le dicta cómo debe trabajar. Es más, el flujo de mensajes intestino-cerebro supera con creces al que se produce en sentido inverso. Todas estas peculiaridades le han conferido el apelativo de «segundo cerebro».
1.2 Una microbiota mutualista
El intestino animal es el hogar de una cantidad casi inconcebible de microorganismos, y sin ellos no seríamos lo que somos. No obstante, nuestra relación con los componentes de la microbiota se describe a menudo como «comensal» (un socio resulta beneficiado mientras que al otro no le afecta ni positiva ni negativamente), lo que refleja nuestra falta de conocimiento o, al menos, una actitud agnóstica hacia las contribuciones de la mayoría de los ciudadanos de esta sociedad microbiana en aras de nuestra salud y bienestar. Realmente, se trata de una relación de mutualismo, ya que ambos socios obtienen beneficios de la relación. Por ejemplo, las bacterias del biorreactor intestinal degradan un variado menú de polisacáridos que, de otra manera, resultarían indigestibles mientras que el hospedador les proporciona un delicioso buffet de polisacáridos en un agradable ambiente anóxico.
En otras palabras, sería más apropiado ver a los animales que nos rodean y a nosotros mismos como un conjunto de muchas especies, en el que nuestro bagaje genético está integrado tanto por los genes animales/humanos propios de cada especie como por los genomas de nuestros socios microbianos (el microbioma). El conjunto del genoma animal/humano y del genoma de los distintos microorganismos que habita en un hospedador constituye el metagenoma. En consecuencia, los animales somos superorganismos cuyo metabolismo representa una amalgama de propiedades microbianas y del propio hospedador1. De hecho, la microbiota intestinal se comporta como un verdadero órgano ya que: (a) está compuesta por diferentes líneas celulares con capacidad de comunicarse entre ellas y con el hospedador; (b) consume, almacena y redistribuye energía; (c) interviene en transformaciones químicas esenciales para la fisiología del hospedador, y (d) es capaz de mantenerse y repararse por sí misma mediante procesos de autorreplicación. No es de extrañar que el microbioma intestinal (con un número de genes que puede ser más de 100 veces superior al de nuestro genoma) se encargue de toda una serie de funciones que, afortunadamente, nuestras células eucariotas no han tenido que adquirir durante el proceso evolutivo.
La composición de la microbiota intestinal de los animales vertebrados (y, en especial, de la especie humana) ha sido objeto de numerosas investigaciones durante las últimas décadas. Hasta los años 80, el estudio de la microbiota intestinal dependía de la continua mejora en los procedimientos de enriquecimiento y en los sistemas para la generación de ambientes anaerobios. Los aislados se identificaban y caracterizaban mediante la combinación de diversos ensayos fenotípicos. En los últimos años, la nueva generación de técnicas de secuenciación (NGS, Next Generation Sequencing), en combinación con el resto de las denominadas técnicas ómicas, ha complementado y, en cierta forma, revolucionado la visión proporcionada por los procedimientos clásicos basados en el empleo de medios de cultivo. No obstante, las técnicas de cultivo (incluyendo la emergente culturómica) siguen siendo esenciales para entender la adquisición, composición y funciones de nuestra microbiota.
La diversidad presente en el tracto gastrointestinal parece ser el resultado de un férreo proceso de selección y coevolución que actúa a dos niveles: (a) el microbiano, en el que las estrategias individuales de los microorganismos (tasa de crecimiento, utilización de sustratos…) afectan a su aptitud para vivir en un ensamblaje competitivo, y (b) el del hospedador, ya que una funcionalidad subóptima del «cóctel microbiano» puede reducir la aptitud del hospedador2. Aquellos consorcios microbianos cuya actividad integrada resulte en un coste para el hospedador provocaran la existencia de menos hospedadores y, en consecuencia, la pérdida de su propio hábitat. Por lo tanto, la diversidad intestinal reflejaría un proceso de selección de bacterias específicas (o, lo que es lo mismo, de sus genomas y sus transcriptomas), cuyo comportamiento colectivo resulte beneficioso para el hospedador y confiera un cierto grado de elasticidad frente a distintos tipos de estrés. Es decir, se promueve activamente la cooperación y la estabilidad funcional del ecosistema
