Cuando un niño les pide a los Detective Boys encontrar a su hermano mayor desparecido, Conan cree que está a punto de encontrarse con la Organización que lo encogió. Al final del caso, Conan conoce a una mujer que afirma ser "Sherry", la creadora del APTX 4969, la droga que le administraron en el primer capítulo de la serie. En este capítulo aparece por primera vez Ai Haibara, una chica nueva en la escuela de los Detective Boys que parece tener un interés particular en Conan y una conexión muy importante con la Organización de los Hombres de Negro.